Bien qu’il en soit le héros, le maître apparaît très tard dans le roman (presque à la moitié du livre). C’était un homme de trente-huit ans environ, au visage rasé au cheveux noirs, au nez pointu, avec des yeux inquiets et une mèche qui pendait sur son front. C’est un écrivain désespéré par l’échec de son roman . «  Le monstrueux échec de mon roman m’avait ,pour ainsi dire arraché une partie de mon âme ». Après avoir quitter son travail dans un musée il entame l’écriture d’un roman sur Ponce Pilate. Il est soutenu dans son effort par Marguerite, sa maîtresse. Le roman est censuré par les critiques officiels (cf. contexte historique). Envoyé dans un asile, seul Woland pouvait le sortir de cette situation. De nombreux rapprochements peuvent être faits entre le Maître et Boulgakov  : les critiques qui l’ont méprisé (certains personnages du roman ont été inspirés par des personnes réelles que Boulgakov a connu), la difficulté dans la construction de leur œuvre qu’ils détruisent chacun en partie (« Je sortis du tiroir les lourdes copies du roman […] et entrepris de les brûler »), une femme qui les accompagnait dans leur travail
Des chapitres du Maître et Marguerite se confondent avec ceux écrit par le Maître. C’est un roman dans le roman. Boulgakov écrit une histoire dont il fait « traiter » une partie par son héros !!! La relation entre l’écrivain et son héros est très forte. En début de livre la transition entre ces deux mondes est brutale. (Par exemple le passage entre les chapitres 1 et 2). D’un coté une histoire qui se passe à Moscou vers 1930 et qui a pour héros le diable, de l’autre Jérusalem au début de notre ère qui met en scène Ponce Pilate et Yeshoua (vraisemblablement Jésus). Un lien entre ces deux mondes se tissent progressivement. Le Maître, héros de Boulgakov y retrouve son propre héros, le diable rencontre Matthieu Lévi, les personnages se rejoignent dans un « au delà » qui n ‘est ni l’enfer, ni le paradis.
A la fin de son périple à Moscou le diable demande au couple s'il veut quitter la terre avec lui. Ils sont d'accord. Dans l'au delà ils rencontrent Ponce Pilate regrettant la mort du Messie. Ils trouvent la paix auprès d'artistes célèbres décédés avant eux.